文章题目：A high-resolution transcriptomic and spatial atlas of cell types in the whole mouse brain 

 发表时间：2023年12期

 期刊名称：Nature 

 影响因子：5839

 实验平台：10x单细胞测序；MERFISH数据集

01 研究概述

 为了描绘小鼠全脑的细胞类型图谱，本研究利用单细胞转录组分析（scRNA-seq）和单细胞核转录组分析（snRNA-seq）对小鼠大脑细胞进行鉴定，并结合MERFISH数据，依据空间位置及细胞类型将这些细胞划分为7个邻域，随后进行深入分析。

2 大脑神经元空间分类

 神经元细胞类型在全脑细胞类型中占据重要比例，且展现出高度的区域特异性。本研究进一步对神经元细胞群体进行详细分析，以确认不同神经元类型的区域特异性。结果表明，鉴定出6个神经元亚群域，涵盖各种大脑区域的细胞特征。

3 非神经元及未成熟神经元细胞类型分类空间分布特征

 在研究中，NN-IMN-GC邻域囊括5种非神经元细胞类型、4种未成熟神经元类型及4种颗粒细胞类型。其中，Astro-Epen类表现出最为多样的空间分布模式，其五个亚类在整个脑室的不同区域内展示出精细的空间特异性。VLMC类型则显示高度的空间特异性与共定位模式。

4 大脑区域特定的细胞类型特征

 本研究还利用MERFISH脑组织数据集定量分析各细胞亚类的全脑空间分布模式。结果发现所有神经元亚类均局限于特定脑区，而非神经元亚类的分布则相对广泛。此外，转录组相似的细胞类型在空间上也更为接近。需要指出的是，下丘脑、中脑和后脑区域细胞聚类较多，而这些区域内细胞类型间的转录组相似性表明，其层次化程度相对较低。

02 文章小结

 本研究通过单细胞联合空间技术，全面解析了小鼠大脑细胞图谱，系统分析了神经元与非神经元细胞类型，探讨了各自的转录组特性及空间特异性之间的关联性。研究结果揭示了不同脑区细胞类型组织的独特特征，尤其是大脑背侧和腹侧的显著区别。背侧部分包含相对较少但高度分化的神经元类型，而腹侧部分则含有更为多样的神经元类型。总之，完整的小鼠大脑空间细胞图谱为生物医疗研究提供了重要的参考基础，尤其是在探索与尊龙凯时相关的生物机制方面。